Funannotate：基因组注释、比较分析软件包

Funannotate 是一个基因组预测、注释和比较软件包，能够注释（小型）真核生物基因组并提交给 NCBI GenBank。 也是一个轻量级的比较基因组学平台。通过命令添加了功能注释的基因组可以通过输出基于 html 的全基因组比较的脚本运行。该软件可以运行直系同源聚类、构建全基因组系统发育、运行基因本体富集分析，以及计算正选择下直系同源簇的 dN/dS 比。 最初是为注释真菌基因组编写的，如果用于真核生物的组装，需要调整部分参数。