Hic的替代技术Omni C，用于染色体定相

内容翻译自：https://omni-c.readthedocs.io/en/latest/ Omni-C提供了 Hi-C 文库的所有特征，而没有基于限制酶 (RE) 的 Hi-C 方法固有的序列偏差。

Omni-C 的主要优势：

• 与序列无关的染色质片段化能够在全基因组范围内检测染色质接触（使用基于限制性内切酶的 Hi-C 方法无法覆盖多达 20% 的基因组）
• 类似Shotgun测序的均匀基因组覆盖，支持 SNP 识别、染色体定相和结构变异检测
• 降低测序负担以达到所需的序列深度，从而节省时间和成本

使用场景

• SNP 和染色体定相：Omni-C™ 文库的均匀序列覆盖率支持依赖 SNP 信息的全基因组 SNP 识别和下游应用，例如由于低转换错误率而导致的染色体定相。Omni-C™ 技术提供了使用 Illumina 短读长进行全基因组物理定相的最佳方法。
• Omni-C™ 数据中的大型 SV：邻近连接数据可用于以高分辨率检测和确认癌症样本中的染色体重排。使用 HiGlass 等开源软件工具，接触矩阵可以快速可视化此类大型结构变体。