调控网络的构建 Cytoscape & string
常用的工具 某个基因的研究现状--pubmed文献自动分析工具EVEX数据库 cytoscape的插件 参考链接 string string教程
Cytoscape的使用
Cytoscape官网
cytoscape中文教程-Y大宽
Cytoscape是一个基于Java的网络构建程序,在它的基础上有许多现成的可用的包,用于网络构建等等。官网包括软件下载,软件依赖检测,相关社区,相关包cytoscape的所有插件包,教程。
主要汉化讲述:差异基因的网络构建
从APPs—— APP manager …… 从中输入目标包STRING
,install
同样安装其他的包
Agilent Literature Search
,GeneMANIA
,
WikiPathways
NDEx
GeneMANIA
也可以从上述地址下载jar文件,手动从APP manager里面安装。
默认的物种是人类,需要根据自己的实际物种修改。