读书清单：生物序列分析 Biological Sequence Analysis

就这本书来说，第四、六、七、八章是纯粹的忽悠。第一章必读，可以与第十一章结合起来看，讲的是基本的概率统计模型，极其有用，这部分不看，这本书你就别看了。第二章的双序列比较可以看看，但我觉得不如我上课讲的清楚。第三章隐马模型有点儿难，可看可不看；第四章用HMM做双序列比对可看可不看；第五章讲的就是Pfam的思想，这个其实可以不看；第六章多序列比对、第七章分子进化建树、第八章进化树的概率论方法可看可不看；第九、十章讲RNA的二级结构预测，相当的难，可以简单地看看。所以，这本书其他章节你看不看影响不太大，但第一章必须非常非常认真地看。我很老实的承认，这本书做学生的时候我认真看的也就第一章，当时理解起来很困难。几年之后终于明白了第一张的内容，再往后看就发现其实并没有那么复杂。当然RNA结构预测部分我还是没看明白。

___引自薛宇博客 重点章节推荐：第1章，第11章。