人类:全基因组关联分析(GWAS)发现非编码变异位点的后续分析
转载自https://mp.weixin.qq.com/s/ts7AD_r7gEXVuXSEx02Ohw 全基因组关联分析(GWAS)发现的变异位点如果是非编码的,那么这个位点需要进行以下分析: - 1)是否调控基因表达(eQTL); 通过GTEx(https://gtexportal.org/home/)查询 - 2)是否影响增强子活性; 通过http://lcbb.swjtu.edu.cn/EnhancerDB/查询 - 3) 是否影响转录因子(TF)结合特异性;通过GVATdb(http://renlab.sdsc.edu/GVATdb/search.html)查询。 如果上面都不是,那可能就没有作用。