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调控网络的构建 Cytoscape & string

常用的工具 某个基因的研究现状--pubmed文献自动分析工具EVEX数据库 cytoscape的插件 参考链接 string string教程

Cytoscape的使用

Cytoscape官网 cytoscape中文教程-Y大宽 Cytoscape是一个基于Java的网络构建程序,在它的基础上有许多现成的可用的包,用于网络构建等等。官网包括软件下载,软件依赖检测,相关社区,相关包cytoscape的所有插件包,教程。 主要汉化讲述:差异基因的网络构建 从APPs—— APP manager …… 从中输入目标包STRING,install 同样安装其他的包 Agilent Literature Search,GeneMANIA, WikiPathways
NDEx GeneMANIA 也可以从上述地址下载jar文件,手动从APP manager里面安装。 image.png

默认的物种是人类,需要根据自己的实际物种修改。

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