| TAIR |
拟南芥 |
http://www.arabidopsis.org/ |
| SIGnAL |
拟南芥 |
http://signal.salk.edu/ |
| RARGE |
拟南芥 |
http://rarge.psc.riken.jp/ |
| Rice Genome Annotation Project |
水稻 |
http://rice.plantbiology.msu.edu/ |
| RAP-DB |
水稻 |
http://rapdb.dna.affrc.go.jp/ |
| SOL genomics network |
茄科 |
http://solgenomics.net/ |
| Gramene |
禾本科 |
http://www.gramene.org/ |
| GrainGenes |
麦类作物 |
http://wheat.pw.usda.gov/GG2/index.shtml |
| SoyBase |
大豆 |
http://www.soybase.org/ |
| MazieGDB |
玉米 |
http://www.maizegdb.org/ |
| CyanoBase |
蓝细菌 |
http://genome.kazusa.or.jp/cyanobase/ |
| GDR (Genome Database for Rosaceae) |
蔷薇科 |
http://www.bioinfo.wsu.edu/gdr/ |
| Brassica Genome Gateway |
芸苔 |
http://brassica.bbsrc.ac.uk/ |
| Cucurbit Genomics Database |
葫芦科 |
http://www.icugi.org/ |
| Phytozome |
植物 (全基因组信息) |
http://www.phytozome.net/ |
| PlantGDB |
植物(全基因组或/大规模 EST信息) |
http://www.plantgdb.org/ |
| EnsemblPlants |
植物(全基因组信息) |
http://plants.ensembl.org/index.html |
| ChloroplastDB |
植物(叶绿体基因组) |
http://chloroplast.cbio.psu.edu/ |
| KEGG PLANT |
植物(全基因组或/大规模 EST信息) |
http://www.genome.jp/kegg/plant/ |
| #2.转录因子数据库 |
|
|
| Database |
URL |
Species |
| --- |
--- |
--- |
| RARTF |
http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ |
拟南芥 |
| AGRIS, AtTFDB |
http://arabidopsis.med.ohio-state.edu/AtTFDB/ |
拟南芥 |
| DATF |
http://datf.cbi.pku.edu.cn/ |
拟南芥 |
| DRTF |
http://drtf.cbi.pku.edu.cn/ |
水稻 |
| DPTF |
http://dptf.cbi.pku.edu.cn/ |
白杨 |
| TOBFAC |
http://compsysbio.achs.virginia.edu/tobfac/ |
烟草 |
| SoybeanTFDB |
http://soybeantfdb.psc.riken.jp/ |
大豆 |
| PlantTFDB |
http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/ |
22种植物 |
| PlnTFDB |
http://plntfdb.bio.uni-potsdam.de/v3.0/ |
20种植物 |
| GRASSIUS, GrassTFDB |
http://grassius.org/grasstfdb.html |
玉米、水稻、高粱、甘蔗 |
| LegumeTFDB |
http://legumetfdb.psc.riken.jp/ |
大豆、百脉根、蒺藜苜蓿 |
| DBD |
http://dbd.mrc-lmb.cam.ac.uk/DBD/index.cgi?Home |
多于700物种 |
| 转载自https://www.lifeomics.com/?p=24759 |
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| 在线做GO、KEGG富集分析，查找同源基因工具，（支持ensembl上的物种） |
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